以上是總結的部分作物類、林木類、動物、水產(chǎn)和中藥材的下機數(shù)據(jù)結果展示,從以上的數(shù)據(jù)不難看出,平均raeds長度幾乎均在20Kb以上,最長reads高達1.6Mb以上(不同樣品DNA抽提難易程度不同,會造成一定的影響)。
上表中最后一列MeanQual就是下機數(shù)據(jù)的質(zhì)量值,與堿基準確度的換算公式為:準確度 = 1-10^(-Q/10),經(jīng)計算? Nanopore下機數(shù)據(jù)單堿基的平均準確率約為86%左右,這樣經(jīng)過校正的數(shù)據(jù)再用Canu、SMARTdenovo、WTDBG等軟件進行基因組的組裝,再經(jīng)過二代數(shù)據(jù)的polish之后,堿基的準確度可達到99.99%以上呢!
評估結果顯示基因完整度均在90%以上!!說明Nanopore數(shù)據(jù)的組裝連續(xù)性和完整性都是非常好的,是值得廣大科研工作者信賴的哦!
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