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生物信息分析軟件

多款工具,多種場(chǎng)景

繪圖工具集成了多款數(shù)據(jù)展示工具,在方便總覽數(shù)據(jù)的同時(shí),還可:1.調(diào)整繪圖——以合適的方式展示數(shù)據(jù)的分布;2.交互查看——點(diǎn)擊圖片相應(yīng)區(qū)域,查看對(duì)應(yīng)數(shù)據(jù)詳情。目前可繪制圖形包括:熱圖、韋恩圖、柱圖、餅圖、箱線圖、散點(diǎn)圖、點(diǎn)線圖、面積圖。

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百邁客云表格工具平臺(tái)集成了四款實(shí)用的表格工具,對(duì)用戶的各種表格文件進(jìn)行方便快捷的操作,免去下載-處理-上傳等繁瑣的步驟。通過(guò)設(shè)置各項(xiàng)參數(shù),可以實(shí)現(xiàn)表格行列名編輯、表格排序、表格篩選、表格合并的功能。

Fasta工具集APP是一款針對(duì)生物信息基本的fasta格式序列處理的綜合性軟件。它包括fasta序列的提取、過(guò)濾、長(zhǎng)度分布圖繪制、格式轉(zhuǎn)換、與數(shù)據(jù)庫(kù)及參考基因組比對(duì)、序列功能注釋等一系列功能。

使用矩陣數(shù)據(jù)文件進(jìn)行熱圖繪制,可以對(duì)矩陣數(shù)據(jù)進(jìn)行篩選,歸一化和聚類等處理。多用于不同樣品間基因表達(dá)水平聚類分析。

對(duì)通過(guò)與數(shù)據(jù)庫(kù)的比對(duì),對(duì)FASTA格式文件的序列進(jìn)行功能注釋。

BLAST,全稱Basic Local Alignment Search Tool,即“基于局部比對(duì)算法的搜索工具”

對(duì)給定的基因集結(jié)合注釋信息繪制GO分類富集圖、KEGG分類富集及通路富集圖。

加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析(WGCNA)是一種從表達(dá)數(shù)據(jù)中挖掘基因模塊(module)信息的算法,可以用于分析各種表達(dá)譜數(shù)據(jù),還可以用于二代測(cè)序數(shù)據(jù)得到的表達(dá)量數(shù)據(jù)。

topGO小工具是一款做功能富集的軟件,采用Bioconductor的包topGO,分析過(guò)程基于差異表達(dá)顯著基因的篩選以及GO term富集分析以及結(jié)果展示。

共有126款分析軟件和工具

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