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微生物絕對定量

反映微生物真實數(shù)量及差異

微生物絕對定量簡介

常規(guī)的相對豐度分析忽略了不同樣本之間總體微生物量存在的現(xiàn)實差異,造成了分析結(jié)果的偏差。而絕對定量分析則是計量樣本每種微生物的16S基因拷貝數(shù)或者細胞數(shù)目,從而實現(xiàn)絕對定量,因此相對于常規(guī)16S相對定量擴增子測序,絕對定量分析能反映樣本每種微生物的真實數(shù)量和組間樣本的真實差異。

微生物/16S/細菌/擴增子絕對定量
相對豐度分析無法準確反映樣本中的真實微生物量

微生物絕對定量發(fā)展

微生物絕對定量發(fā)展

百邁客微生物絕對定量介紹

百邁客運用高通量測序技術(shù)和spike-in內(nèi)標法實現(xiàn)對細菌的絕對定量。通過在樣品中加入已知拷貝數(shù)的spike-in內(nèi)參序列,與樣品同時進行擴增、建庫測序,然后通過內(nèi)參的理論拷貝數(shù)與測序tags數(shù),繪制標準曲線,結(jié)合標準曲線及樣品的組織、核酸、擴增用量等計算得到OTUs/ASVs的絕對拷貝數(shù)表。能夠一次獲得所有細菌的絕對定量結(jié)果,包括總豐度和每種菌的豐度。

百邁客微生物絕對定量技術(shù)路線

百邁客微生物絕對定量技術(shù)路線

百邁客微生物絕對定量產(chǎn)品類型

產(chǎn)品類型

產(chǎn)品類型 支持區(qū)域 數(shù)據(jù)量 分析內(nèi)容
細菌絕對定量(三代) 16S全長 1W CCS 常規(guī)擴增子分析+絕對定量
細菌絕對定量(二代) 16S V3-V4,16S V4 5W tags 常規(guī)擴增子分析+絕對定量

送樣量

組織類型 送樣量
土壤 1~2g
糞便 0.5~2g

備注:上述組織送樣量均為三次提取的量

百邁客微生物絕對定量產(chǎn)品優(yōu)勢

技術(shù)成熟

技術(shù)成熟

曾發(fā)文Nature期刊,運用范圍廣,土壤、糞便、腸道菌群皆可適用。

性價比高

性價比高

一次測序能夠獲得兩份報告,絕對定量+相對定量結(jié)果。

種水平定量

種水平定量

結(jié)合三代絕對定量測序能夠?qū)崿F(xiàn)種水平絕對定量。

數(shù)據(jù)準確

數(shù)據(jù)準確

經(jīng)rrnDB數(shù)據(jù)矯正,16s rRNA基因拷貝數(shù)更接近細胞數(shù)。

微生物絕對定量應(yīng)用場景

微生物絕對定量案例分享
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