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百創(chuàng)S系列空間轉錄組細胞分割

技術原理

百創(chuàng)智造S系列空間轉錄組細胞分割實現(xiàn)原理: 三圖合一 百創(chuàng)智造基于S系列空間芯片的底層設計,開發(fā)出了自己的核心技術,可以得到完全沒有錯誤的原片熒光圖像以及H&E圖像且與芯片完全對齊?;跓晒膺M行細胞核的定位刻畫細胞核的邊界;基于HE的校準輔助刻畫細胞的邊界,通過邊界信息映射到芯片上,提取相應位置的測序數(shù)據(jù),實現(xiàn)精準的單細胞分割。

輔助軟件

同時,對于細胞類型差異大的片子以及植物樣本,百創(chuàng)智造也匹配了免費的可視化軟BSTCellViewer,可以手動進行細胞的修改、圈定。

產(chǎn)品特點

亞細胞級分辨率

分辨率最高可達4.8μm,較國外主流技術分辨率提高400倍。

原片熒光染色+原片H&E染色+原片空間測序相結合技術

既可以進行表達芯片H&E染色,又同時可以再表達芯片上進行熒光染色,保證細胞分割更準確。

靈活樣本策略

可根據(jù)樣本數(shù)量,靈活定制1~8個捕獲區(qū)域,且還可以根據(jù)組織大小,選擇3中不同面積(6.8mm*6.8mm、11mm*11mm、15mm*20mm)的捕獲區(qū)域大小。

無錯位且高清的圖像

芯片采用半導體加工級別的微孔矩陣,以及提供BSTCellViewer細胞圈定軟件,可以實現(xiàn)對原片進行單細胞圈定,分割實現(xiàn)以單細胞為單位進行聚類分析。

部分數(shù)據(jù)

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