微生物絕對(duì)定量簡(jiǎn)介

常規(guī)的相對(duì)豐度分析忽略了不同樣本之間總體微生物量存在的現(xiàn)實(shí)差異，造成了分析結(jié)果的偏差。而絕對(duì)定量分析則是計(jì)量樣本每種微生物的16S基因拷貝數(shù)或者細(xì)胞數(shù)目，從而實(shí)現(xiàn)絕對(duì)定量，因此相對(duì)于常規(guī)16S相對(duì)定量擴(kuò)增子測(cè)序，絕對(duì)定量分析能反映樣本每種微生物的真實(shí)數(shù)量和組間樣本的真實(shí)差異。

微生物絕對(duì)定量發(fā)展

百邁客微生物絕對(duì)定量介紹

百邁客運(yùn)用高通量測(cè)序技術(shù)和spike-in內(nèi)標(biāo)法實(shí)現(xiàn)對(duì)細(xì)菌的絕對(duì)定量。通過(guò)在樣品中加入已知拷貝數(shù)的spike-in內(nèi)參序列，與樣品同時(shí)進(jìn)行擴(kuò)增、建庫(kù)測(cè)序，然后通過(guò)內(nèi)參的理論拷貝數(shù)與測(cè)序tags數(shù)，繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線，結(jié)合標(biāo)準(zhǔn)曲線及樣品的組織、核酸、擴(kuò)增用量等計(jì)算得到OTUs/ASVs的絕對(duì)拷貝數(shù)表。能夠一次獲得所有細(xì)菌的絕對(duì)定量結(jié)果，包括總豐度和每種菌的豐度。

百邁客微生物絕對(duì)定量技術(shù)路線

百邁客微生物絕對(duì)定量產(chǎn)品類型

技術(shù)成熟

曾發(fā)文Nature期刊，運(yùn)用范圍廣，土壤、糞便、腸道菌群皆可適用。

性價(jià)比高

一次測(cè)序能夠獲得兩份報(bào)告，絕對(duì)定量+相對(duì)定量結(jié)果。

種水平定量

結(jié)合三代絕對(duì)定量測(cè)序能夠?qū)崿F(xiàn)種水平絕對(duì)定量。

數(shù)據(jù)準(zhǔn)確

經(jīng)rrnDB數(shù)據(jù)矯正，16s rRNA基因拷貝數(shù)更接近細(xì)胞數(shù)。