答:lncRNA的預(yù)測包含基本篩選和潛在編碼能力篩選兩部分。
(1)篩選長度≥200bp,Exon個數(shù)≥2,F(xiàn)PKM≥0.1的轉(zhuǎn)錄本序列進行后續(xù)編碼潛能預(yù)測;
(2) 應(yīng)用主流的CPC分析、CNCI分析、CPAT分析、pfam蛋白結(jié)構(gòu)域分析四種方法對基本篩選獲得的轉(zhuǎn)錄本進行編碼潛能預(yù)測,保留不具編碼潛能的轉(zhuǎn)錄本序列,四種方法取交集即為最后預(yù)測出的LncRNA。
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