答：基于lncRNA與其靶基因的作用方式，我們采用2種預測方法進行l(wèi)ncRNA的順式靶基因和反式靶基因進行預測：
第一種，lncRNA調(diào)控其鄰近基因的表達，主要根據(jù)lncRNA與gene的位置關系預測，lncRNA 100kb范圍內(nèi)的鄰近基因為其順式靶基因；
第二種，當樣本數(shù)目比較多時，通過樣本間 lncRNA 與 mRNA 的表達量相關性分析方法來預測 lncRNA的反式靶基因。