產品介紹
????????全長轉錄組測序是利用PacBio平臺對某一物種的mRNA進行測序研究,因其可直接獲得從5’端到3’端的高質量轉錄組信息而稱為全長轉錄組測序。全長轉錄組測序無需組裝,直接獲得單分子全長mRNA信息,同時可準確鑒定基因的可變剪接、APA、融合基因、基因家族和非編碼RNA等信息,全長轉錄組成為近年來的一大研究熱點。
全長轉錄組百邁客優(yōu)勢
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分析流程再升級,項目周期更短
百邁客全長轉錄組項目建庫測序和信息分析全面升級,經各個環(huán)節(jié)嚴格把控:
純三代全長轉錄組僅需30個工作日!
2+3全長轉錄組項目僅需40個工作日!
兩個月極速完成二代和三代聯(lián)合分析,對于想快速發(fā)文章的科研工作者,采用三代新技術研究生物學問題無疑是很好的選擇。
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分析內容更專業(yè)、更全面
百邁客全長轉錄組新增分析內容:
(1)轉錄因子預測
????????轉錄因子也稱反式作用因子,在動植物的生長發(fā)育及其對外界環(huán)境的反應中起著重要的調控作用,通過轉錄因子注釋或表達量聚類分析,挖掘調控生物表型的關鍵轉錄因子。
(2)可變剪接結果可視化交付
????????可變剪接在產生轉錄本多樣性、控制調節(jié)生長發(fā)育等方面起決定性作用,可變剪接可視化能夠對外顯子結構進行展示,有助于更直觀分析轉錄本可變剪切事件。
(3)差異可變剪接分析
????????通過rMATS軟件分析獲得獲得不同分組之間的差異可變剪接事件。
(4)Circos圖
????????通過Circos圖可以直觀比較基因組和三代測序結果中基因密度、轉錄本密度,以及l(fā)ncRNA和融合轉錄本在染色體分布。
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數(shù)據產出創(chuàng)新高、質量更好
????????采用官方發(fā)布升級的Sequel2.1試劑,近期百邁客三代測序研發(fā)人員經大量實驗條件摸索,數(shù)據產出又創(chuàng)新高,由11-12G/Cell提升到了18-20G/Cell的平均水平。同時,平均酶讀長也達到了30K以上。酶讀長的有效增加,有利于拿到更多的高質量全長轉錄數(shù)據,從而有效提高全長轉錄組的分析質量。
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項目經驗豐富,國內合作成功案例更多
????????自2015百邁客從事全長轉錄組的科學研究服務,為廣大科研工作者提供了新的研究視角。截止2018年7月,百邁客全長轉錄組已發(fā)表文獻共6篇,研究的物種分別有楊樹、甘薯、野生甘薯、兔子、跳甲和辣椒,覆蓋領域分別為林木、哺乳動物、昆蟲和作物等。
????????百邁客全長轉錄組數(shù)據產出更高、周期更快、分析更全面,為回饋廣大科研者對百邁客的支持,百邁客特推出全長轉錄組贈送優(yōu)惠活動:
優(yōu)惠一:加量不加價
提高測序數(shù)據量可以覆蓋更多低豐度,低表達轉錄本,從而獲得更全面的轉錄本信息。
15Gb全長轉錄組現(xiàn)價29999,免費贈送3Gb,數(shù)據量提升至18Gb;
30bG全長轉錄組現(xiàn)價55000,免費贈送5Gb,數(shù)據量提升至35Gb;
優(yōu)惠二:2+3全長轉錄組聯(lián)合分析
全長轉錄組可以準確分析轉錄本結構,二代數(shù)據利用其優(yōu)勢,可以對轉錄組本定量,從而實現(xiàn)對轉錄本定性和定量研究。
2018年9月30日之前簽訂合同并送樣品,即可享受二代測序1200/樣。
優(yōu)惠三:免費贈送全長轉錄組線上培訓班名額
百邁客不定期推出線上全長轉錄組培訓班,詳細解讀分析結果和數(shù)據挖掘,助您快速實現(xiàn)文章的轉化。
活動期間簽訂全長轉錄組合同,即免費贈送百邁客全長轉錄組線上培訓班名額一個,部分課程如下:
課程名稱 | 內容介紹 |
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全長轉錄組實驗原理及測序方案選擇 | 實驗原理、測序策略(文庫、數(shù)據量) |
基因結構/基因功能研究方案設計及文章架構解析 | 數(shù)據挖掘角度、圖表解析、文章寫作思路 |
全長轉錄組與蛋白組/基因組聯(lián)合研究 | 數(shù)據挖掘角度、圖表解析、文章寫作思路 |
全長轉錄組結題報告解讀:有參、無參 | 分析流程、軟件原理、參數(shù)選擇、分析結果解讀 |
活動時間:8月1日—9月30日