百邁客已有十年科技服務經(jīng)驗,在十年的成長道路上,為越來越多的轉錄組測序項目提供驗證實驗服務,轉錄組+qPCR定量驗證已成為科學研究的常見技術。
百邁客秉承“持續(xù)創(chuàng)新、追求卓越、客戶至上、拼搏奮進、團結協(xié)作”的核心價值觀,十年科研服務經(jīng)驗,致力于打通基因測序與結果驗證,給客戶提供更全面的科研服務。基于十年科服經(jīng)驗和qPCR技術團隊實驗經(jīng)驗,正式推出試劑盒產(chǎn)品Biomarker 2X SYBR Green Fast qPCR Mix,用于高通量測序結果的基因驗證。
新品上市,怎么能沒有活動呢?接好啦~~
活動內(nèi)容
轉錄組滿12個樣品,免費贈送qPCR試劑盒,高達500次反應/盒。
活動時間:2020年3月份
活動要求:
1、三月份完成簽單和送樣;
2、贈送試劑盒待項目結題后,由所在地區(qū)區(qū)域經(jīng)理負責配送;
3、文章發(fā)表時,需注明轉錄組測序分析及qPCR試劑盒由百邁客提供,見刊后提供全文。
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案例分享
英文題目:Global transcriptomic analysis of zebrafish in response to embryonic exposure to three antidepressants, amitriptyline, fluoxetine and mianserin
中文題目:轉錄組分析斑馬魚胚胎暴露于三種抗抑郁藥(阿米替林,氟西汀和米安色林)的應答機理
發(fā)表雜志:Aquatic Toxicology
影響因子:4.129
合作單位:上海大學環(huán)境與化學工程學院
研究背景
人用和獸用藥物是一種新興的有機污染物,首次發(fā)現(xiàn)是在20世紀70年代的時候,在污水流出物中檢測出。藥物的生產(chǎn)和發(fā)展旨在治愈疾病、改善人類健康,但由于過量或過期藥物的隨意排放,同時廢水處理廠(WWTPs)對大多數(shù)藥物殘留的去除較為低效,所以低濃度藥物及其分解產(chǎn)物仍然廣泛分布在水生系統(tǒng)中。
抗抑郁藥是全球治療焦慮、恐慌癥和抑郁癥最常用的藥物。它們也是水生環(huán)境中最常檢測到的藥物。已有研究表明,多種抗抑郁藥物在水生環(huán)境及水生生物中積累,抗抑郁藥物可能會影響水生生物的繁殖能力、生存、生長、捕食和學習行為,但是抗抑郁藥物影響水生生物的作用機制仍然難以明確。
作者為了更好地了解不同種類抗抑郁藥誘導的毒性反應在非靶向魚類中的作用機制,用分屬于不同抗抑郁藥物類別的阿米替林(Amitriptyline hydrochloride)、氟西?。‵luoxetine hydrochloride)和鹽酸米安色林(mianserin hydrochloride)對早期發(fā)育階段的斑馬魚胚胎進行處理,然后進行了轉錄組測序(RNA-Seq),基于前面轉錄組的分析結果,作者采取兩組qPCR驗證實驗:
1.?DEG表達模式驗證
作者根據(jù)RNA- seq結果選取了15個基因(4個上調(diào)、11個下調(diào)),用qPCR驗證其表達模式。結果表明,qPCR結果與RNA-Seq結果相似(圖3A~C)。此外,通過線性擬合和皮爾遜相關性方法分析了RNA-Seq和qPCR的結果間的相關性,結果表明兩種方法的分析結果呈顯著正相關(圖3D~F)。
2.不同濃度的抗抑郁藥物處理下DEG的應答反應
作者用三種不同濃度的抗抑郁藥(0.1、1和10 μg /L)處理斑馬魚胚胎,應用qPCR試驗確定6個選定的基因的濃度—應答關系。結果表明,ptgdsb的mRNA水平只在1 μg /L阿米替林和10 μg /L米安色林處理組顯著降低;而dusp5表達水平在10 μg /L阿米替林和米安色林處理組以及所有氟西汀處理組中均顯著降低;除了在1和10 μg /L阿米替林處理組中的nr1d1表達水平未受抑制之外,nr1d1和per2在幾乎所有抗抑郁藥物處理組均受到顯著抑制。此外,兩個與早期生長應答相關的基因egr1和egr4在0.1和10 μg /L阿米替林處理組和所有米安色林處理組中表達下調(diào),egr4在所有氟西汀處理組降低,而egr1只在0.1和10 μg /L氟西汀處理組中表達降低(圖4)。
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