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 分類: 市場活動

想學(xué)習(xí)如何分析微生物多樣性數(shù)據(jù)?想了解每步操作參數(shù)的意義?2021年百邁客針對老師們對微生物多樣性內(nèi)容的需求,特開辦微生物多樣性生信課程,面向全體科研工作者,系統(tǒng)學(xué)習(xí)微生物多樣性分析中常規(guī)內(nèi)容與分析過程。課程設(shè)計覆蓋linux基本操作、QIIME2數(shù)據(jù)分析、百邁客云分析三部分內(nèi)容。

課程亮點

1、基于QIIME2完成所有基本分析內(nèi)容;

2、豐富齊全的學(xué)習(xí)文檔所有課程都有詳細的學(xué)習(xí)文檔,每一步的操作步驟都會在文檔中詳細列出;

3、隨時在線實戰(zhàn)練習(xí)每位生信學(xué)員均配有自己的專屬練習(xí)賬號,練習(xí)服務(wù)器24小時不停機,保證學(xué)員隨學(xué)隨用,課下即可學(xué)以致用;

4、理論與實操相結(jié)合,系統(tǒng)學(xué)習(xí)微生物多樣性課程;

5、免費且長期的售后答疑群,保障學(xué)員課下學(xué)習(xí)課后還可反復(fù)觀看上課視頻,有問題隨時售后群中交流溝通,真正實現(xiàn)“線上學(xué)習(xí)理解,課后練習(xí)指導(dǎo),課下文檔復(fù)習(xí);

6、講師團隊專注于微生物領(lǐng)域5年以上,具有豐富的項目經(jīng)驗和培訓(xùn)經(jīng)驗;

課程內(nèi)容

物種豐度柱狀圖:每個柱子表示一個樣品,一種顏色代表一個物種,色塊長度表示物種所占相對豐度比例。通過物種分布柱狀圖即可以展示各樣品優(yōu)勢物種及組成,又可以清晰觀察到優(yōu)勢物種在不同樣品種的豐度變化趨勢。

物種豐度聚類熱圖:以顏色梯度來代表數(shù)據(jù)矩陣中數(shù)值的大小并根據(jù)物種或樣品豐度相似性進行聚類的一種圖形展示方式。將高豐度和低豐度的物種分塊聚集,通過顏色梯度及相似程度來反映多個樣品群落組成的相似性和差異性。


稀釋性分析:用于驗證測序數(shù)據(jù)量是否足以反映樣品中的物種多樣性,并間接反映樣品中物種的豐富程度。在一定范圍內(nèi),隨著測序條數(shù)的加大,若曲線表現(xiàn)為急劇上升則表示群落中有大量物種被發(fā)現(xiàn);當(dāng)曲線趨于平緩,則表示此環(huán)境中的物種并不會隨測序數(shù)量的增加而顯著增多


PCoA分析:原理是假設(shè)對N個樣品有衡量它們之間差異或距離的數(shù)據(jù),就可以用此方法找出一個直角坐標(biāo)系,將N個樣品表示成N個點,而使點間的歐式距離的平方正好等于原來的差異數(shù)據(jù),實現(xiàn)定性數(shù)據(jù)的定量轉(zhuǎn)換,從多維數(shù)據(jù)中提取出主要的元素和結(jié)構(gòu)。


隨機森林分析:隨機森林(Random Forests)是一種基于決策樹的經(jīng)典高效的機器學(xué)習(xí)算法,對于經(jīng)常呈現(xiàn)離散、不連續(xù)分布的微生物群落數(shù)據(jù)而言尤其適用,近幾年已有研究證明這一算法能夠?qū)ξ⑸锶郝錁颖具M行有效且準(zhǔn)確的分類。

課程列表

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