作者之前已經(jīng)證明香蕉OFP促進果實成熟。香蕉中OFP1（MaOFP1）與MADS-box蛋白MuMADS1相互作用對于香蕉采后乙烯促進成熟產(chǎn)生拮抗作用。然后，香蕉果實的成熟過程也成為果實質(zhì)量的一個部分。MuMADS1和MaOFP1果實品質(zhì)形成方面，是否有的新的作用，目前尚不清楚。
本篇文章以野生型、突變體番茄、三種不同轉(zhuǎn)基因系M（過表達MuMADS1）、O（過表達MaOFP1）、MO（同時過表達MuMADS1和MaOFP1）為實驗材料，運用轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)，解析了MuMADS1和MaOFP1對果實品質(zhì)形成方面的分子機制。
研究結(jié)果
（1）差異表達基因（DEGs）數(shù)目分析
下圖表明了MuMADS1 和 MaOFP1能調(diào)節(jié)突變體中差異基因數(shù)目
(a) WT vs. ovate; (b) WT vs. MuMADS1 transformants; (c) WT vs. MaOFP1 transformants; (d) WT vs.
MuMADS1 + MaOFP1 transformants; (e) ovate vs. MuMADS1 transformants; (f) ovate vs. MaOFP1 transformants; (g) ovate vs. MuMADS1 + MaOFP1
transformants.
（2）差異基因的功能注釋和富集分析
COG分類表明淀粉、蔗糖和碳代謝構(gòu)成了外源基因整合最主要的代謝途徑，這些基因可能是果實品質(zhì)形成期活躍的基因。
Histogram of COG classifification.
(a) WT vs. ovate; (b) WT vs. MuMADS1 transformants; (c) WT vs. MaOFP1 transformants; (d) WT vs.
MuMADS1 + MaOFP1 transformants; (e) ovate vs. MuMADS1 transformants; (f) ovate vs. MaOFP1 transformants; (g) ovate vs. MuMADS1 + MaOFP1
transformants.
本文通過轉(zhuǎn)錄組差異基因數(shù)據(jù)分析及通路注釋，解析了MuMADS1和 MaOFP1共同調(diào)控果實品質(zhì)的性狀的分子機制。類似的分析內(nèi)容在轉(zhuǎn)錄組相關(guān)文獻中已成為標準必備。百邁客云平臺（BMKCloud）基于此，已開發(fā)了一系列測序數(shù)據(jù)分析平臺，涵蓋多個研究方向。
該文章中的火山圖等這些圖表利用百邁客云上的小工具均可免費實現(xiàn)，只需3步即可快速在線可視化生成。
步驟主要包括：
1、導(dǎo)入數(shù)據(jù)
2、點擊提交
3、圖形優(yōu)化
百邁客云除可實現(xiàn)以上文章中圖表之外，還可以免費利用在線工具制作百余種RNA-Seq測序分析結(jié)果繪制圖（部分案例）：
***************************************************************
百邁客云平臺
一、云平臺簡介：
由北京百邁客生物科技有限公司研發(fā)，面向?qū)τ谖锓N生物信息分析、文獻精準查找、及科研文章繪圖有大量需求的廣大科研工作者。其主要特點是運用方便快捷，操作簡單，實現(xiàn)隨時隨地便捷服務(wù)，加快文章產(chǎn)出的速度。
分析平臺主要包括：真核生物有參考基因組的轉(zhuǎn)錄組分析平臺、真核生物無參考基因組的轉(zhuǎn)錄組分析平臺、全轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析平臺（小RNA和長鏈非編碼RNA）、代謝組分析平臺、蛋白質(zhì)組分析平臺、以及有參全長轉(zhuǎn)錄組（ONT）分析等45個分析平臺。
二、成功案例：
據(jù)不完全統(tǒng)計，從2016年至今，目前成功案例已有150余篇，累計影響因子500以上，主要涵蓋動植物基因組領(lǐng)域、微生物領(lǐng)域、以及部分醫(yī)學(xué)臨床應(yīng)用領(lǐng)域。解決了客戶大數(shù)據(jù)分析的問題，縮短了發(fā)表文章的時間。以下是部分統(tǒng)計結(jié)果：
京公網(wǎng)安備 11011302003368號