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 分類: 微生物組測序
?百邁客代謝組分析平臺于2018年上線,為廣大客戶群體提供無門檻的代謝組分析服務(wù),自上線以來,收獲了大量好評和建議,百邁客代謝組分析平臺保持升級和優(yōu)化,本期代謝組分析平臺新增了高頻熱點分析內(nèi)容:Kmeans聚類分析、箱線圖、小提琴圖、雷達圖個性化分析以及PCoA、火山圖、Z-score和差異代謝物箱線圖交互式分析。話不多說,接下來給各位老師介紹本次更新內(nèi)容,歡迎老師可訪問網(wǎng)址http://www.biocloud.net/免費注冊體驗。①在應(yīng)用中心中選擇-代謝組分析平臺

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更多的代謝組數(shù)據(jù)挖掘圖片類型

1、k-means聚類分析可將在不同組含量增減趨勢相似的代謝物分成若干個聚類,用于研究每個聚類中的代謝物是否具有相似的功能或直/間接的調(diào)控關(guān)系;
2、主坐標分析可用研究差異分組之間和組內(nèi)樣本之間的變異度大小。PCoA圖交互式可實現(xiàn)數(shù)據(jù)標簽的顯示,更改散點形狀和大小,添加置信橢圓和填充顏色等自定義功能;
3、箱線圖和小提琴圖可以反映數(shù)據(jù)的分布情況和變異程度,小提琴圖結(jié)合了箱式圖和密度圖的特征,主要用來顯示數(shù)據(jù)的分布性狀。箱線圖和小提琴圖可直觀展示組間顯著差異的代謝物。

更全面的差異代謝物鑒定

1、雷達圖 (Radar Chart) 是用來比較多個定量變量的方法,可用于查看哪些變量具有相似數(shù)值,或者每個變量中有沒有任何異常值。雷達圖可展示出組間顯著差異代謝物,一般挑選log2FC絕對值大的前10個代謝物進行雷達圖的展示。
2、Z-score分析:Z-score是基于代謝物的定量值轉(zhuǎn)換而來的值,用于衡量實驗組相對于對照組的差異偏離情況。通過Z-score圖可展示不同兩組間差異代謝物的偏離情況。
3、通過火山圖(Volcano Plot)可以快速地查看代謝物在兩個組中含量的差異總體趨勢,以及代謝物差異的統(tǒng)計學(xué)顯著性。差異表達火山圖交互式可實現(xiàn)顯示數(shù)據(jù)標簽,更改散點形狀,顯示代謝物名稱/代謝物等自定義功能。
4、百邁客差異代謝物箱線圖交互式可實現(xiàn)箱體顏色修改,是否顯示數(shù)據(jù)點,差異性檢驗P值或*值等自定義功能。

以上就是本期代謝組分析平臺更新的所有內(nèi)容,歡迎各位老師前往體驗,百邁客代謝組分析平臺也將持續(xù)升級,為您提供高效便捷的可視化分析服務(wù)。

百邁客多組學(xué)一站式服務(wù)

百邁客多組學(xué)測序服務(wù)包括:基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白組、代謝組、微生物組、單細胞和空間組學(xué)、群體研究等組學(xué)檢測服務(wù),利用高知識人才,構(gòu)建了全面的多組學(xué)產(chǎn)品服務(wù)以及多組學(xué)聯(lián)合分析流程,從而滿足科研工作者多組學(xué)整合研究的個性化需求。

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