西瓜屬泛基因組揭示西瓜的進化和馴化歷程

期刊：Plant Biotechnologe Journal

IF：13.8

時間：2023年8月

全文：http://cysolarrack.com/wp-content/uploads/2023/08/plant-biotechnology-journal-2023-.pdf

該研究首先以3份野生西瓜種為材料組裝基因組，隨后結合已發(fā)表3個西瓜基因組進行比較基因組分析，發(fā)現(xiàn)野生西瓜和栽培西瓜間存在較大的染色體間重排，并基于共線性區(qū)塊推測了西瓜的分化關系。接著，對201份野生西瓜進行了重測序，并結合已有重測序數(shù)據(jù)對547份西瓜材料進行泛基因組構建，并基于該泛基因組鑒定到了栽培西瓜在馴化過程中受選擇的關鍵基因，例如調(diào)節(jié)西瓜果肉中的糖積累的糖轉運蛋白ClTST2基因。

牛筋草高質(zhì)量基因組揭示草甘磷靶基因復增新機制

期刊：Nature Communications

IF：16.600

時間：2023年7月

全文：http://cysolarrack.com/wp-content/uploads/2023/08/2023-nc-.pdf

該研究首先構建了草甘膦敏感和草甘膦抗性牛筋草高質(zhì)量基因組，并基于該基因組和重測序數(shù)據(jù)將草甘膦靶基因EPSPS定位于3號染色體上。進一步研究發(fā)現(xiàn)，在草甘膦抗性牛筋草中，EPSPS基因與其它幾個基因融合后形成復增片段插入到基因組的一個或多個亞端粒區(qū)域，而非單基因復增。此外，由于牛筋草染色體亞端粒區(qū)序列高度重復，功能基因較少，從而使牛筋草以較小的代價獲得新抗性，促進抗性種群快速進化。