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隨著高通量測(cè)序行業(yè)的高速發(fā)展,測(cè)序價(jià)格大幅下降,轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的爆發(fā)式增長,隨之而來發(fā)表轉(zhuǎn)錄組文章愈發(fā)困難,那么如何解決這一現(xiàn)狀呢?其一需要對(duì)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行深入挖掘,結(jié)合生物體表型闡述機(jī)制;其二在系統(tǒng)生物學(xué)和功能基因組時(shí)代,轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合其他組學(xué)數(shù)據(jù)整體上解釋生物學(xué)問題,如將轉(zhuǎn)錄組、基因組、蛋白組、代謝組等多個(gè)組學(xué)聯(lián)合運(yùn)用。而對(duì)于生信基礎(chǔ)較為薄弱的科研工作者,采用多組學(xué)分析無疑成為文章快速發(fā)表的有效途徑之一。為了滿足廣大科研工作者需求,百邁客強(qiáng)勢(shì)推出“蛋白組和代謝組”多組學(xué)分析。

蛋白組篇

以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的定量蛋白質(zhì)組學(xué),主要可以分成兩類,第一種是穩(wěn)定同位素標(biāo)記的定量蛋白質(zhì)組學(xué),比如iTRAQ;第二種是非標(biāo)記的定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),比如label-free。iTRAQ定性定量結(jié)果更為準(zhǔn)確,通量較高可同時(shí)標(biāo)記2-8個(gè)樣本,但是對(duì)樣本數(shù)有一定限制且不適用于低豐度蛋白的定量,適合小樣本量的項(xiàng)目;label-free檢測(cè)肽段范圍廣,單次可鑒定和定量較多的蛋白質(zhì),但由于樣品單獨(dú)進(jìn)行質(zhì)譜檢測(cè)所以重現(xiàn)性較低,在大量算法的基礎(chǔ)上更適合大量樣本的蛋白組研究。

 

代謝組篇

非靶向代謝組和廣靶代謝組是目前代謝組學(xué)常用的技術(shù)。非靶向代謝組是將對(duì)照組和實(shí)驗(yàn)組樣本的全部代謝物進(jìn)行比對(duì),以找出其代謝物的差異。廣靶代謝組是高通量、高靈敏度靶向代謝物檢測(cè)技術(shù),提供了定性、定量檢測(cè)大批量、低豐度代謝物高效的方法, 有助于全面解析差異代謝物與代謝途徑。

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