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 分類: 微生物組測序

標題:Lack of short-chain fatty acids and overgrowth ofopportunistic pathogens define dysbiosis of neuromyelitis optica spectrumdisorders: A Chinese pilot study

中文標題:視神經(jīng)脊髓炎譜系疾病與腸道機會致病菌的過度繁殖、短鏈脂肪酸的缺乏有關(guān)

發(fā)表時間:2018.8

期刊:Multiple Sclerosis Journal(MSJ)

影響因子:5.28

通訊作者:陸正齊(教授)陸勇軍(教授)

作者單位:中山大學(xué)附屬第三醫(yī)院中山大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院

研究背景

視神經(jīng)脊髓炎譜系疾病NMOSD)是一種中樞神經(jīng)系統(tǒng)(CNS)的炎癥性自身免疫疾病,是視神經(jīng)和脊髓同時或相繼受累的急性或亞急性脫髓鞘病變。視神經(jīng)脊髓炎譜系疾病具有高復(fù)發(fā)和高致殘性,具有人種差異和性別差異(男女患病比例為1:10),通常與其他自身免疫疾?。ㄈ缦到y(tǒng)性紅斑狼瘡、橋本氏病等)共病。長期以來,NMOSD可通過免疫學(xué)標記(如水通道蛋白-4抗體,AQP4-IgG)或遺傳基因標記(如人類白細胞抗原,HLA)鑒定,與幽門螺桿菌等病原相關(guān)的抗體在NMOSD患者的腸胃中也被普遍發(fā)現(xiàn)。NMOSD患者腸道微生物的研究目前仍較少,本文采用高通量測序(NGS)和氣相色譜(GC)技術(shù),分析了NMOSD患者的腸道微生物與短鏈脂肪酸(SCFAs)變化情況。

材料方法

樣品類型:人體糞便。

樣品來源:84名中國NMOSD患者(AQP4-IgG血清反應(yīng)呈陽性),54名健康人群(HCs);84名NMOSD患者中,66名使用免疫抑制劑(27名使用霉酚酸酯mmf,32名使用硫銼嘌呤azathioprine,7名服用環(huán)流酰胺、甲氨蝶呤或利妥昔單抗),18名NMOSD患者不做治療。

分析平臺:Illumina MiSeq PE250:16S rRNA;GC:SCFAs。

結(jié)果與分析

1、NMOSD與HCs腸道微生物存在差異

首先,擬桿菌門(Bacteroidetes)、厚壁菌門(Firmicutes)和變形菌門(Proteobacteria)這3門菌在腸道含量最多(圖 1a);擬桿菌屬(Bacteroides)、普氏菌屬(Prevotella)、志賀氏菌屬(Shigella)和糞球菌屬(Faecalibacterium)占腸道微生物的(屬水平)70%(圖 1b)。PCA分析顯示NMOSD與HCs人群腸道微生物組成有明顯差異(p<0.001,Mann–Whitney U)(圖 2a;2c),而不同免疫抑制治療劑與非治療對腸道微生物的組成影響不大(圖 2b;2d)。


2、NMOSD患者腸道微生物群的差異分布

LEfSe分析表明,鏈球菌屬(Streptococcus)、志賀氏菌屬(Shigella)和糞球菌屬(Faecalibacterium)在視神經(jīng)脊髓炎譜系疾病與HCs人群腸道中存在差異(LDA,log 10= 4)(圖 3)。Metastats分析表明,視神經(jīng)脊髓炎譜系疾病與HCs人群腸道有60個菌屬存在顯著差異(p<0.05),其中17個屬相對豐度大于0.001%。Boruta特征選擇顯示,在17個差異屬中,鏈球菌屬(Streptococcus)的重要度Z值(Importance Z-score)最高(圖 4)。相關(guān)性分析顯示,鏈球菌屬(Streptococcus)與病癥嚴重程度(EDSS)顯著正相關(guān)(p<0.05)。宏基因組分析顯示,鏈球菌屬(Streptococcus)的S.oralis、S.salivarius、S. parasanguinis、S. pneumonia和S. mitis為主要菌種,S. oralis、S. pneumonia和S. mitis在NMOSD與HCs人群腸道中豐度差異顯著。

免疫抑制治療比較發(fā)現(xiàn),鏈球菌屬(Streptococcus)、志賀氏菌屬(Shigella)主要集中于NMOSD人群,糞球菌屬(Faecalibacterium)在HC人群中最豐富。與非治療組相比,NMOSDs人群的鏈球菌屬(Streptococcus)在使用mmf、azathioprine后略有降低(圖 5c),但在HC人群中更低。與非治療相比,NMOSDs人群的免疫抑制治療劑(mmf、azathioprine & others)治療對志賀氏菌屬(Shigella)的抑制作用不明顯(圖 5d)。雖然,HC人群比非治療NMOSDs人群的糞球菌屬(Faecalibacterium)略高,然而,免疫抑制治療劑(mmf、azathioprine)使糞球菌屬(Faecalibacterium)反而顯著降低(圖 5e)。

總之,除了azathioprine顯著降低NMOSDs人群的鏈球菌屬(Streptococcus),其他免疫抑制治療劑均不會顯著改變腸道菌群。

3、NMOSD與HC人群的腸道SCFAs水平

從上述研究發(fā)現(xiàn),NMOSD患者腸道中缺乏合成SCFAs的菌群,但引起該患者癥狀的機會致病菌大量繁殖。因此,本文運用GC技術(shù)研究NMOSD與HC人群腸道SCFAs(醋酸纖維、丙酸鹽和丁酸鹽),結(jié)果發(fā)現(xiàn),NMOSD患者的3種SCFAs濃度均顯著低于HC人群(p<0.001)(圖 6a-c)。非參數(shù)相關(guān)性分析(Spearman)表明(圖 6d)),SCFAs(醋酸纖維、丁酸鹽)濃度分別與EDSS顯著負相關(guān)(p<0.05);特異性產(chǎn)SCFAs細菌(毛螺旋菌Lachnospira)豐度與SCFAs濃度顯著正相關(guān)。此外,mmf、azathioprine及其他免疫抑制治療劑對SCFAs濃度的影響存在差異。

結(jié)論

日常生活中,勞累或感冒后出現(xiàn)視力下降等現(xiàn)象經(jīng)常被忽視,然而,這可能是“視神經(jīng)脊髓炎”的征兆。本研究發(fā)現(xiàn),相對于健康人群,中國視神經(jīng)脊髓炎譜系疾病患者的腸道菌群中有一種機會致病菌——鏈球菌屬(Streptococcus)顯著增加,而能產(chǎn)生具有抗炎作用的短鏈脂肪酸的細菌豐度在視神經(jīng)脊髓炎譜系病患者中顯著降低。腸道菌群及其代謝產(chǎn)物能參與‘腦-腸軸’活動并對中樞神經(jīng)系統(tǒng)相關(guān)疾病的發(fā)病起關(guān)鍵作用。本研究為今后的視神經(jīng)脊髓炎譜系疾病患者精準診斷與靶向性治療提供科學(xué)依據(jù)。

 

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