近日,北京百邁客生物科技有限公司再次引進Nanopore平臺測序儀PromethION啦!
小科普
Nanopore平臺是新興的實時單分子納米孔測序技術平臺:借助單個分子通過納米孔時引起孔兩側(cè)電位差來實現(xiàn)信號檢測,納米孔的直徑僅允許單個核苷酸聚合物通過,而ATCG四種堿基的帶電性質(zhì)不同,因此通過電信號差異特征即可檢測出通過納米孔的堿基類型,從而實現(xiàn)測序。
目前百邁客實驗室內(nèi)Nanopore平臺儀器除了MinION、GridION X5以外,已經(jīng)擁有三臺PromethION測序儀!是目前國內(nèi)占有量最多且全部儀器均在運行中的公司!
這能說明什么呢?
說明從此:
測序不再等!
大數(shù)據(jù)隨心測!
多量樣本同期測!
結(jié)果到手快人一步!
PromethION操作展示:
(實時操作)
(精準上樣)
為什么要引進這么多臺?當然是為了增加產(chǎn)量啦,目前每臺每48小時可產(chǎn)出1TB哦。有人可能會問能支持不同物種嗎?答案是當然可以。請看下表:
草本
灌木
喬木
水產(chǎn)
動物
作物
注:Species:分析的物種信息;SeqNum:各個長度范圍內(nèi)序列的數(shù)目;SumBase:指各個長度范圍內(nèi)序列的總長度;N50Len:reads N50長度;N90Len:readsN90長度;MeanLen:平均reads長度;MaxLen:最長reads長度;MeanQual:質(zhì)量值,準確度=1-10^(-Q/10)
以上是目前百邁客在線項目中使用PromethION進行測序的部分下機數(shù)據(jù)~相關數(shù)據(jù)實在太多啦(后臺數(shù)據(jù)不斷不斷的在更新)!這邊僅僅按照物種分類來給大家簡短的展示一下針對不同類別物種的數(shù)據(jù)實際產(chǎn)出情況。根據(jù)物種本身雜合度、難抽提程度以及測序深度的不同會對測序及組裝結(jié)果有一定的影響哦~
無論是動物植物還是微生物、無論是基因組轉(zhuǎn)錄組還是宏基因、無論是舊數(shù)據(jù)的更新還是高難度物種的破譯,Nanopore都能出彩表現(xiàn)~
北京百邁客生物科技有限公司是中國大陸一家全部通過?PromthION/GridION平臺及DNA/RNA樣本官方認證的公司。
截至目前為止,百邁客已經(jīng)建立超過上百種物種類型的文庫,擁有大量的項目經(jīng)驗!無論是技術還是項目經(jīng)驗上,我們都實力過硬!如今越來越多可喜的結(jié)果已經(jīng)交付到各位老師的手中~
截至今年12月,百邁客2018年合作文章影響因子累計超過500+!Nature Genetics、Nature Communications、Molecular Plant…合作項目文章源源不斷!
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