特级丰满少妇一级AAAA爱毛片,亚洲AV无码专区一级婬片毛片,真实的国产乱ⅩXXX实拍,中文字幕一区二区三区四区,国产成人无码91精品一区69

 分類: 醫(yī)學(xué)研究

做過ChIP-seq和ATAC-seq的小伙伴想必都知道Motif預(yù)測吧,大家覺得比較常用又好用的軟件大概就是MEME-ChIP組件了吧。網(wǎng)上有很多教軟件安裝使用的教程,網(wǎng)站分析界面也很友好,所以我們不講如何使用,而是講如何看結(jié)果。

我們根據(jù)實(shí)際需求,從MEME-ChIP的原始分析結(jié)果中提取了精華,提供了較為全面完整的分析結(jié)果:

1、每個(gè)motif的logo圖

2、motif注釋結(jié)果(JASPAR)

3、MEME注釋結(jié)果與Peak靶基因的聯(lián)合結(jié)果

4、MEME-ChIP所有的HTML版結(jié)果

前三條一般情況下是足夠的啦,但是小編就是比較執(zhí)著,就想看看MEME-ChIP的原始分析結(jié)果都是什么,接下來我們就開始吧。

為了方便所有人,小編特意在網(wǎng)站上做了一版,這樣想學(xué)習(xí)的大家都可以復(fù)現(xiàn)啦。

先準(zhǔn)備數(shù)據(jù),這里是一個(gè)ATAC-seq預(yù)測的Peak數(shù)據(jù),我們選取Peak峰周圍幾百bp的DNA序列作為輸入,記住一定要是FASTA格式的數(shù)據(jù)哦。如果你自己沒有的話,網(wǎng)站也提供了示例數(shù)據(jù),你可以在這里找到:

然后上傳數(shù)據(jù),開始分析,小編在這里全部使用默認(rèn)參數(shù):

點(diǎn)擊開始后,就可以耐心等待啦~

一段時(shí)間后你就可以從郵箱里找到你的分析結(jié)果鏈接,下載下來解壓就是這個(gè)樣子的:

打開meme-chip.html,接下來就是這樣子的:

小結(jié)

1、使用MEME-ChIP的時(shí)候務(wù)必保證輸入序列是等長的。

2、MEME-ChIP中嵌套的de novo Motif Discovery工具是MEME和DREME,Motif Enrichment工具是CentriMo和SpaMo,Motif Camparison(Motif注釋)軟件是Tomtom,Motif Scanning工具是FIMO。

3、MEME和DREME的區(qū)別是:MEME用于發(fā)現(xiàn)較長的Motif(約21bp);DREME用于發(fā)現(xiàn)較短的Motif(約8bp)

4、CentriMo和SpaMo的區(qū)別是:CentriMo用于發(fā)現(xiàn)Motif(de novo發(fā)現(xiàn)的Motif+給定的已知數(shù)據(jù)庫中的Motif)在輸入序列上的富集,另外CentriMo要求輸入序列等長;SpaMo(Motif間距分析),以Cluster后的Motif作為primary motif,以de novo發(fā)現(xiàn)的Motif和給定的已知數(shù)據(jù)庫中的Motif為secondary motif,找到在輸入序列上在相對primary motif出現(xiàn)位置的特定距離處富集的secondary motif。

如果您還有看不明白的,歡迎點(diǎn)擊下方按鈕聯(lián)系我們,我們將安排技術(shù)支持與您一對一進(jìn)行項(xiàng)目討論。

最近文章
EEUSS鲁片一区二区三区四虎 | 国产免费无码成人A片软件 97久久精品人人澡人人爽 | 美女喷水网站乱伦 | 97人妻人人揉人人躁人人免费 | 真人BBBBBBBBB毛片 | 杏吧成人无码区免费A片 | 欧美乱妇日本无乱码特黄大片 | 高清无码国产日高中生活 | 我把黑丝美女操喷水内射视频 | 中文久久乱码一区二区 | 免费无遮挡无码永久在线观看视频 | 人妻熟女A级A片 | 可以直接观看的黄色视频网址 | 美女视频黄在线观看网站 | 成人A片无码水蜜桃免费网站软件 | 刘诗诗毛片一区二区三区 | 中文幕无线码中文字蜜桃 | 调教我的妺妺H肉yin荡视频 | 视色4se免费无码网站 | 搡BBBB 搡BBB小说图 | 国内精品 欧美日韩 | A片久久国产首拍精品AV | 99精品欧美一区二区三区综合在线 | 国产丰满农村妇女一区区 | 色费女人18毛片A级毛片视频 | 欧一美一色一伦一区二区三区 | 国产精品传媒无码成人猛烈 | 国产伦精品一区二区三区四区视频 | 国产老熟女伦老熟妇露脸 | 黄色A片手机板在线播放 | 少妇毛片一区二区三区粉嫩aV | 自慰 免费网站com | 国内精品久久久久久久星 | 国产伦精品一区二区视频 | 很很操狠狠爱很很鲁 | 要灬要灬再深点受不了混乱 | 久久久91人妻无码精 | 国产又粗又猛又黄又爽无遮挡 | 国产激情无码AV毛片多多 | 亚洲国产中文字幕 | 蜜桃视频污在线免费观看 |