攜三代測序和生物云平臺(tái)為疫情抗擊免費(fèi)提供技術(shù)支持,百邁客在行動(dòng)!
新型冠狀病毒疫情對我國人民的生產(chǎn)生活產(chǎn)生了較大影響,牽動(dòng)著大家的心。舉國上下都十分重視,我們的一線醫(yī)護(hù)人員沖在了抗擊疫情的最前線,大家也都從各方面提供著各種援助,充分體現(xiàn)了我們一方有難八方支援的優(yōu)良傳統(tǒng)。
作為一種新型冠狀病毒,我們對它的了解還不夠,我們的臨床科學(xué)家們也在想盡各種辦法加班加點(diǎn)研究這種新型冠狀病毒,以便盡快研究清楚它的生物學(xué)分子機(jī)理,正如1月26日,在國務(wù)院新聞辦疫情新聞發(fā)布會(huì)上,中國疾病預(yù)防控制中心主任高福院士表示的,要結(jié)合多種技術(shù)手段來幫助做病毒的解析。百邁客作為三代測序和生物云服務(wù)提供商,結(jié)合自身的技術(shù)特點(diǎn),也積極的參與到抗擊疫情的戰(zhàn)斗中,用自己的技術(shù)為抗擊疫情貢獻(xiàn)一份力量。
針對此次疫情,百邁客積極與一線的醫(yī)護(hù)和科研人員合作,結(jié)合一線的需求,積極調(diào)動(dòng)各種資源,經(jīng)過十幾天夜以繼日的開發(fā),終于把第一版新型冠狀病毒(nCov)基因組數(shù)據(jù)庫分析平臺(tái)上線,為我們的一線科研人員提供免費(fèi)服務(wù)?,F(xiàn)把階段性開發(fā)進(jìn)展和支持方式公布如下,希望對加快破解和管控疫情提供有效支撐:
1、?“病毒數(shù)據(jù)庫&自動(dòng)化分析平臺(tái)/工具” 向社會(huì)免費(fèi)共享
自2019年12月疫情首現(xiàn)以來,百邁客研發(fā)團(tuán)隊(duì)及時(shí)跟進(jìn)疫情研究進(jìn)展。目前已完成一期研發(fā)計(jì)劃,我們通過對各數(shù)據(jù)庫中的新型冠狀病毒數(shù)據(jù)進(jìn)行合理整合分析,及時(shí)搭建了“新型冠狀病毒數(shù)據(jù)庫分析平臺(tái)”(http://ncovdb.biocloud.net/home) ,本數(shù)據(jù)庫于2020年1月27日20:00時(shí)正式上線。本數(shù)據(jù)庫將配合國家公共資源數(shù)據(jù)庫為社會(huì)提供更全面、及時(shí)、準(zhǔn)確的數(shù)據(jù)資源。
數(shù)據(jù)庫部署了31個(gè)新型冠狀病毒基因組序列,其中MN938384、MN908947、MN975262等菌株均已補(bǔ)充詳細(xì)的基因組、編碼基因及蛋白序列信息,我們還基于這31個(gè)菌株,2株MERS作為外源構(gòu)建了物種進(jìn)化樹,以便更清晰解讀新型冠狀病毒的進(jìn)化樹起源。研究人員可便捷下載基因組數(shù)據(jù)資源,亦可通過我們部署的Blast、GBrowse、Primer Design 等工具完成相關(guān)的初步數(shù)據(jù)分析、挖掘。
我們將持續(xù)跟進(jìn)、并更新該數(shù)據(jù)庫,為國內(nèi)外科研工作者提供方便快捷的數(shù)據(jù)檢索及下載服務(wù)。在隨后的二期、三期研究計(jì)劃中,我們會(huì)繼續(xù)部署各種自動(dòng)化分析工具,分析保守域、菌株間的變異信息,尋找菌株間的共性的突變信息,為病毒致病機(jī)理的研究、疫苗的開發(fā)等提供技術(shù)支持。
2、三代納米孔技術(shù)助力病毒變異監(jiān)測
三代測序技術(shù)作為基因組學(xué)研究的新興技術(shù),對病毒的組學(xué)研究有著重要作用,作為三代測序技術(shù)服務(wù)提供商,百邁客生物與戰(zhàn)略合作伙伴Oxford Nanopore公司聯(lián)合協(xié)調(diào)了5套MinION測序平臺(tái)及配套試劑盒,各位疫情防控專家如有需求,聯(lián)系評估后隨時(shí)無償配發(fā),保證前線專家做好對疫情的實(shí)時(shí)監(jiān)控、及時(shí)分析;如有建好的2019-nCov病毒測序文庫也可以結(jié)合送樣要求,聯(lián)系我們。
附錄:樣品要求
3、已配備專業(yè)生物信息分析團(tuán)隊(duì),并向社會(huì)無償提供信息分析技術(shù)支持
疫情爆發(fā)以來,我們組織20余人的生信分析團(tuán)隊(duì)提前結(jié)束假期,不斷針對發(fā)布的病毒基因組進(jìn)行研究分析,隨時(shí)待命加入抗擊疫情的隊(duì)伍。同時(shí),百邁客亦誠懇邀請、歡迎各位專家學(xué)者共同探討疫情防控良策,請聯(lián)系18514282648(微信同號(hào))進(jìn)群討論。
4、其它可調(diào)配資源
如果前線專家需要其它生物技術(shù)支持資源,百邁客生物將不遺余力提供最大的幫助。
24小時(shí)對接聯(lián)系人:
I.數(shù)據(jù)庫使用&數(shù)據(jù)分析對接人:王老師
手機(jī):18514282648(同微信)郵箱:wangf@biomarker.com.cn
II.樣品準(zhǔn)備&測序?qū)尤耍嚎道蠋?/p>
手機(jī):16622926288(同微信)郵箱:kangjm@biomarker.com.cn
我們將全力協(xié)調(diào)公司各種資源,在基因組變異與進(jìn)化,病毒感染與致病機(jī)理分析,病毒溯源等方面為國為民貢獻(xiàn)一份“微薄”之力,在生命的賽道上,分秒必爭!疫情防控?zé)o小事,從你我做起。