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 分類: 醫(yī)學(xué)研究

還在為ChIP實驗步驟多而苦惱??

還在為ChIP實驗周期長而憂愁??

還在為實驗重復(fù)性差而不快??

還在為細胞量不夠而憂悶??

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百邁客新產(chǎn)品 CUT&Tag 上市,

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CUT&Tag技術(shù)原理

CUT&Tag實驗原理[1]

CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是一種可應(yīng)用于表觀遺傳學(xué)領(lǐng)域的DNA-蛋白質(zhì)互作研究新技術(shù),主要用于研究轉(zhuǎn)錄因子或組蛋白修飾在全基因組上的結(jié)合或分布位點。

Cut&tag vs ChIP-seq

百邁客實測數(shù)據(jù)展示

CUT&Tag文庫片段分布圖

H4K20me1實測圖

經(jīng)典案例解讀

蛋白質(zhì)與DNA互作是基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控的關(guān)鍵,也是啟動基因轉(zhuǎn)錄的前提。2019年4月29日Henikoff實驗室在Nature Communication上公布了新技術(shù)CUT&Tag,與傳統(tǒng)的ChIP-seq相比,CUT&Tag技術(shù)方法簡便易行、背景信號低、重復(fù)性好、讓細胞量從10,000個降到了60個甚至單個細胞。

CUT&Tag、CUT&RUN、ChIP-Seq 實驗結(jié)果對比:
CUT&Tag 具有更好的信噪比和更低的背景

重復(fù)性相關(guān)矩陣:
CUT&Tag的靈敏度最高,實驗可重復(fù)性較好

peak-Calling的對比:
CUT&Tag比CUT&RUN、ChIP-seq或ATAC-seq有更高的信號

CUT&Tag 單細胞測序流程:
能夠?qū)O少量細胞(60 個細胞)甚至單細胞進行分析

參考文獻

[1] Kaya-Okur HS, et al. CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells. Nature Communication, 2019.

 

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