想系統(tǒng)學(xué)習(xí)遺傳進(jìn)化常規(guī)分析怎么做?想定制化繪制優(yōu)美的圖形?想了解遺傳進(jìn)化在文章中的應(yīng)用?
這是你嗎?
應(yīng)各位老師需求,百邁客特開辦遺傳進(jìn)化生信分析培訓(xùn)班,面向全體科研工作者,系統(tǒng)學(xué)習(xí)遺傳進(jìn)化中常規(guī)內(nèi)容,并重點(diǎn)進(jìn)行高級(jí)圖形繪制。課程設(shè)計(jì)覆蓋基因流、分化時(shí)間、群體歷史動(dòng)分析三塊當(dāng)前熱點(diǎn)研究?jī)?nèi)容。
課程亮點(diǎn):
1、定制化繪制各種優(yōu)美漂亮圖片
2、豐富齊全的學(xué)習(xí)文檔,每一步驟每一代碼詳細(xì)列出
3、課上課下均可獨(dú)立操作的專門服務(wù)器
4、理論與實(shí)操相結(jié)合,系統(tǒng)學(xué)習(xí)遺傳進(jìn)化課程
5、免費(fèi)且長(zhǎng)期的售后答疑群,保障學(xué)員課下學(xué)習(xí)
6、講師團(tuán)隊(duì)專注于動(dòng)植物領(lǐng)域5年以上,具有豐富的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)和培訓(xùn)經(jīng)驗(yàn)
為了讓大家更系統(tǒng)了解本次課程的相關(guān)培訓(xùn),現(xiàn)將部分教授內(nèi)容展示如下:
系統(tǒng)發(fā)育樹:
又稱系統(tǒng)發(fā)生樹、系統(tǒng)演化樹、種系發(fā)生樹等。表明被認(rèn)為具有共同祖先的各物種之間的演化關(guān)系樹形圖,用來(lái)描述物種之間的分類和演化關(guān)系。本課程帶領(lǐng)學(xué)員學(xué)習(xí)系統(tǒng)發(fā)育樹發(fā)展、相關(guān)術(shù)語(yǔ)、系統(tǒng)發(fā)育樹分類以及建樹步驟,同是針對(duì)分析結(jié)果進(jìn)行圖形化繪制,如下圖。
群體結(jié)構(gòu):
群體結(jié)構(gòu),又稱群體分層,指所研究的群體中存在基因頻率不同的亞群。群體結(jié)構(gòu)分析有助于理解進(jìn)化過(guò)程,并且可以通過(guò)基因型和表型的關(guān)聯(lián)研究確定個(gè)體所屬的亞群。本次課程帶領(lǐng)學(xué)員學(xué)習(xí)structure和admixture兩款軟件,基于deltak和CV值法進(jìn)行分群,并定制化繪制群體結(jié)構(gòu)圖形(分組和不分組、色系調(diào)整等)。
群體結(jié)構(gòu)和系統(tǒng)發(fā)育樹組合圖:
主成分分析:
設(shè)法將原來(lái)眾多的具有一定相關(guān)性的變量(標(biāo)記)重新組合成一組較少個(gè)數(shù)的互不相關(guān)的綜合變量(主成分)。主成分分析主要應(yīng)用:群體分層、outlier篩選、亞群進(jìn)化關(guān)系、群體結(jié)構(gòu)矯正。本次課程利用smartpca軟件進(jìn)行實(shí)際操作,掌握二維圖和三維圖繪制。
選擇清除分析:
自然選擇促使有利突變?cè)谌后w中保留下來(lái),與之連鎖的中性位點(diǎn)突變頻率提升,非連鎖的中性位點(diǎn)突變頻率下降;簡(jiǎn)單的說(shuō)就是基因組某區(qū)域由于受到了選擇而消除多態(tài)性,即遺傳多樣性降低,在群體中出現(xiàn)高頻的等位基因和低頻的等位基因。
針對(duì)這塊生信領(lǐng)域熱點(diǎn)研究?jī)?nèi)容,本次課程主要介紹PopGenome、vcftools兩款軟件,針對(duì)θπ、θw、Fst、Tajima’s D等各種指標(biāo)進(jìn)行分析并圖示化結(jié)果。
除了遺傳進(jìn)化常規(guī)分析內(nèi)容之外,本次課程涵蓋分化時(shí)間、基因流、群體歷史動(dòng)態(tài)三塊高級(jí)分析內(nèi)容。部分結(jié)果展示如下:
課程內(nèi)容列表
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2、不限次直播課程:所選課程對(duì)應(yīng)1年的直播觀看權(quán)限,觀看直播不限次
3、線下活動(dòng):會(huì)員線下活動(dòng)每年至少一次,活動(dòng)不僅有專家、有美食、有美酒同時(shí)還有美景與技術(shù)牛
4、金牌、鉑金會(huì)員另贈(zèng)送百邁客第八屆全國(guó)功能基因組學(xué)峰會(huì)門票(峰會(huì)為>500人會(huì)議,現(xiàn)已舉辦7屆,每屆均有院士大牛參加)
5、收費(fèi)工具免費(fèi)用:生信課程中同樣分析可選擇代碼或在線工具實(shí)現(xiàn),其中收費(fèi)在線工具可有3個(gè)月免費(fèi)使用權(quán)
6、購(gòu)課折扣:超過(guò)會(huì)員卡內(nèi)的課程,每增加一個(gè)可享7折優(yōu)惠