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 分類: 文獻(xiàn)秀

本期分享文獻(xiàn)

文章題目:Evaluation of Sample Preservation Approaches for Better Insect Microbiome Research According to Next-Generation?and Third-Generation Sequencing

發(fā)表期刊:《Microbial Ecology》

發(fā)表時(shí)間:2021年3月

影響因子:4.55

第一作者:楊子文 中山大學(xué)

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昆蟲的共生微生物參與了寄主生存與適應(yīng)的諸多重要環(huán)節(jié),包括消化、營養(yǎng)和防御等,時(shí)常發(fā)揮著關(guān)鍵的作用,因此也被視為推動(dòng)昆蟲快速演化的關(guān)鍵因素之一。隨著對于昆蟲共生微生物的研究從模式生物和經(jīng)濟(jì)類群逐漸拓展到更大多樣性規(guī)模的昆蟲物種,如何在長時(shí)間的野外采集工作中高質(zhì)量地保存樣品,也成為后續(xù)研究中需要有效應(yīng)對的一項(xiàng)挑戰(zhàn)。

本文對昆蟲樣品野外保藏的四種常見方法進(jìn)行了評(píng)估,并分別采用了二代測序技術(shù)以及三代測序技術(shù)對平行數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。2021年3月11日,研究成果以“Evaluation of Sample Preservation Approaches for Better Insect Microbiome Research According to Next-Generation and Third-Generation Sequencing”為題,發(fā)表在學(xué)術(shù)期刊《MICROBIAL ECOLOGY》上。

本期文獻(xiàn)秀邀請了本文第一作者楊子文博士為大家?guī)碓摽蒲许?xiàng)目的研究經(jīng)歷。

活動(dòng)信息

時(shí)間:8月13日 16:00

形式:免費(fèi)線上直播

本期分享嘉賓

楊子文 博士

中山大學(xué)生態(tài)學(xué)專業(yè),獲得南京大學(xué)學(xué)士學(xué)位以及中山大學(xué)碩士學(xué)位。研究方向?yàn)槔媒M學(xué)技術(shù)以及生物信息學(xué)研究蝽類昆蟲與微生物共生關(guān)系的演化。

李漢洲 產(chǎn)品經(jīng)理

畢業(yè)于哈爾濱醫(yī)科大學(xué)生物信息科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,具有6年微生物組學(xué)研究經(jīng)驗(yàn),現(xiàn)任百邁客微生物產(chǎn)品經(jīng)理。

 

分享主題

時(shí)間 主題
16:00-16:40 楊子文:基于二代以及三代測序技術(shù)對常用昆蟲共生微生物樣品保存方法的評(píng)估
16:40-17:20 李漢洲:Pacbio測序技術(shù)在微生物多樣性研究中的優(yōu)勢
17:20-17:30 討論環(huán)節(jié)

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