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提問1:我的qPCR實驗結果,復孔重復新性差,具體是什么原因導致的?
回復: 1)誤差導致,建議加樣過程中,使用精密的移液器,且可增大反應體系。
2)儀器長時間未校準,建議將儀器定期校準。
提問2:擴增曲線未達到平臺期,如何改善?
回復: 1)模板量太低,可適當增加模板量。
2)循環(huán)數(shù)太少,可適當增加循環(huán)數(shù)。
3)基因表達豐度低,建議增加模板量,或者選擇合適的試劑盒,確保 能檢測出較低基因的表達水平。
除此之外,在qPCR擴增實驗過程中,還會出現(xiàn)Ct值偏大、特異性差、熒光強度弱、不適合特有的機型等問題。為了解決以上問題,百邁客推出的一款Biomarker 2× SYBR Green Fast qPCR Mix試劑盒,具有全平臺通用、特異性強、擴增性能優(yōu)越、靈敏度高等特點。
產(chǎn)品簡介
Biomarker 2× SYBR Green Fast qPCR Mix采用SYBR? Green I 嵌合熒光法進行qPCR反應,通過對SYBR? / FAM通道進行熒光信號定量檢測,可以獲得PCR過程中DNA擴增的真實數(shù)據(jù)。Taq DNA酶采用抗體法熱啟動進行擴增,可以有效抑制引物退火導致的非特異性擴增,極大地提高產(chǎn)品的特異性。且試劑盒中含有特殊的ROX Reference Dye,適用于所有qPCR儀器。
產(chǎn)品特點
1.兼容性完美,全平臺通用:提供ROX Reference Dye I和II預混液,適用于所有主流定量PCR儀器。
2.靈敏度高:采用獨特優(yōu)化的反應Buffer,可檢測低至10 pg的cDNA模板。
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圖1:將質粒進行8個10倍梯度稀釋,以5×107~100拷貝/μl的質粒為模板,進行擴增。發(fā)現(xiàn)擴增效率高,且可獲得良好的線性關系。
3.擴增性能優(yōu)越:短時間內(nèi)可反復凍融10次以上,擴增曲線依然呈現(xiàn)特征單峰,擴增效率依然很高。
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圖2:以1 μg不同物種的RNA為模板(藍色:人肝癌細胞;青色:雞;紅色:斑馬魚;黑色:水稻種子),用BiomarkerScript Ⅱ 1st Strand cDNA Synthesis Kit進行逆轉錄,得到cDNA產(chǎn)物。再以100 ng不同物種的 cDNA為模板,用反復凍融10次以上的Biomarker 2× SYBR Green Fast qPCR Mix進行qPCR擴增。
4.特異性強,適應不同樣本:通過抗體封閉聚合酶活性,有極強的特異性,可完美識別植物(種子、葉子、果實)、動物(細胞、組織)等樣本的目標基因擴增。
圖3:以1 μg不同物種的RNA為模板(紅色:人肝癌細胞;藍色:雞;黑色:斑馬魚;紫色:水稻種子;黃色:番茄果),用BiomarkerScript Ⅱ 1st Strand cDNA Synthesis Kit進行逆轉錄,得到cDNA產(chǎn)物。再以100 ng不同物種的 cDNA為模板,用Biomarker 2×SYBR Green Fast qPCR Mix進行qPCR擴增。
5. 重復性好 :設置20個復孔,S型擴增曲線幾乎重合。
圖4:以1μg水稻種子的RNA為模板,用BiomarkerScript Ⅱ 1st Strand cDNA Synthesis Kit進行逆轉錄,得到cDNA產(chǎn)物。再以100 ng的 cDNA為模板,設置20個復孔,用Biomarker 2× SYBR Green Fast qPCR Mix進行qPCR擴增。
轉錄組項目文章發(fā)表,大部分的驗證都采用了qPCR方案,統(tǒng)計部分百邁客成功案例:人、鼠、家禽、水產(chǎn)、昆蟲、經(jīng)濟作物、林木、花卉果蔬等。
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