2021年10月18日,由北京百邁客生物科技有限公司主辦的“第八屆全國(guó)功能基因組學(xué)高峰論壇-動(dòng)物分會(huì)場(chǎng)”線上直播會(huì)議完美落幕。
全國(guó)功能基因組學(xué)高峰論壇始于2014年,每年舉辦一屆,至今已成功舉辦八屆,累計(jì)邀請(qǐng)近800名專家學(xué)者進(jìn)行大會(huì)主題報(bào)告,7000余名與會(huì)科研人員、近百家大眾及行業(yè)合作伙伴、媒體朋友參加此盛會(huì),在業(yè)界形成了較高的行業(yè)影響力和認(rèn)可度。
大會(huì)得到了各位專家、學(xué)者的大力支持,本次論壇動(dòng)物分會(huì)場(chǎng)共邀請(qǐng)到中國(guó)科學(xué)院水生生物研究所何舜平研究員、中國(guó)科學(xué)院南海海洋研究所張揚(yáng)研究員、中國(guó)科學(xué)院海洋研究所許飛研究員、西北農(nóng)林科技大學(xué)姜雨教授、中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)李孟華教授與呂鋒驊副研究員、華南師范大學(xué)李勝教授、武漢大學(xué)趙華斌教授、中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)曲魯江教授等9位著名專家學(xué)者以及北京百邁客生物科技有限公司余瑩經(jīng)理,共同探討研究進(jìn)展及發(fā)展方向。
大會(huì)精彩報(bào)告
中國(guó)科學(xué)院水生生物研究所何舜平研究員充分的介紹了魚(yú)類適應(yīng)性演化相關(guān)研究。研究團(tuán)隊(duì)基于輻鰭魚(yú)類與四足類進(jìn)化年齡、選擇壓力、表達(dá)模式以及相關(guān)的基因功能的比較分析,探討了它們對(duì)脊椎動(dòng)物“登陸”事件以及矛尾魚(yú)進(jìn)化的意義。揭示了早在脊椎動(dòng)物祖先首次登陸之前,許多對(duì)脊椎動(dòng)物登陸至關(guān)重要的肺、心臟和運(yùn)動(dòng)功能的遺傳調(diào)控網(wǎng)絡(luò)就已存在。進(jìn)一步通過(guò)演變中重要地位的肺魚(yú)基因組解析了其肺表面活性劑關(guān)鍵基因、手指形成關(guān)鍵元件保守元件、抗抑郁相關(guān)關(guān)鍵基因。最后何老師基于萬(wàn)種魚(yú)基因計(jì)劃也為我們展示了鯉科魚(yú)類適應(yīng)進(jìn)化的科研成果。
中國(guó)科學(xué)院南海海洋研究所張揚(yáng)研究員詳細(xì)的介紹了貝類基因組的進(jìn)化研究,首先張老師通過(guò)牡蠣基因組揭示了牡蠣通過(guò)固著和左右殼不對(duì)稱的形式,“簡(jiǎn)化”了軀體的發(fā)育模式,并通過(guò)比較基因組學(xué)等研究揭示雙殼貝類足絲發(fā)育和形成、牡蠣起始固著、殼不對(duì)稱等相關(guān)機(jī)制。隨后通過(guò)對(duì)鸚鵡螺基因組測(cè)序解析了其針孔眼形成和生物礦化的機(jī)制。發(fā)現(xiàn)包括基因丟失、特定基因家族的獨(dú)立收縮和擴(kuò)張及其相關(guān)的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)等多種基因組演化事件,可能塑造了鸚鵡螺針孔眼的形成。最后表示,保守的軟體動(dòng)物生物礦化“toolkit”和譜系特異性的重復(fù)低復(fù)雜性域?qū)W鵡螺殼的構(gòu)建至關(guān)重要。
中國(guó)科學(xué)院海洋研究所許飛研究員報(bào)告了牡蠣激素與發(fā)育調(diào)控上的研究進(jìn)展。許老師表示,通過(guò)腎上腺素、多巴胺等激素處理,可以促進(jìn)牡蠣的附著變態(tài)發(fā)生,并已經(jīng)成功應(yīng)用于單體牡蠣培育的生產(chǎn)實(shí)踐?;谵D(zhuǎn)錄組學(xué),代謝組學(xué)等技術(shù),通過(guò)與蛻皮動(dòng)物和后口動(dòng)物的激素調(diào)控系統(tǒng)比較,發(fā)現(xiàn)了牡蠣等冠輪動(dòng)物廣泛利用膽固醇類、酪氨酸衍生物類、多肽類等激素的相關(guān)代謝和作用通路,海洋冠輪動(dòng)物可能具有更加原始和普遍的基因組成。小分子激素可能通過(guò)與核受體類轉(zhuǎn)錄因子相結(jié)合,在牡蠣附著變態(tài)過(guò)程中起到重要調(diào)控作用。
西北農(nóng)林科技大學(xué)姜雨教授報(bào)告詳述了基因滲入對(duì)羊基因組的塑造及其功能改變,其研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)代表了170多個(gè)世界綿羊品種和七個(gè)綿羊?qū)僖吧锓N的全基因組序列分析,發(fā)現(xiàn)平均每只家養(yǎng)綿羊的基因組序列分別來(lái)自于伊朗的野生摩佛倫羊、東方盤(pán)羊和東亞盤(pán)羊的雜交滲入。說(shuō)明起源于野生物種并滲入家養(yǎng)綿羊的獨(dú)特單倍型在表型多樣性和綿羊本地化適應(yīng)中起著重要作用。并發(fā)現(xiàn)綿羊的大角、小角、無(wú)角以及耳朵大小性狀相關(guān)基因。最后表示,從多個(gè)近緣野生物種、馴化祖先種的不同群體之間發(fā)生的滲入事件持續(xù)發(fā)生,遠(yuǎn)比想象的復(fù)雜,需要結(jié)合歷史和地理的遷徙知識(shí)討論。滲入單倍型在多種功能上發(fā)揮作用,其與已存在變異、新發(fā)突變通過(guò)快速組合,適應(yīng)新的環(huán)境。
中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)呂鋒驊副研究員對(duì)全球野生和家養(yǎng)綿羊的遺傳多樣性、跨物種遺傳滲入和重要農(nóng)藝性狀的遺傳基礎(chǔ)進(jìn)行了詳述,研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)158個(gè)不同家養(yǎng)綿羊群體和7個(gè)野生物種共810個(gè)樣本的高深度全基因組遺傳變異,檢測(cè)到大量新的變異。家畜種群中來(lái)自其野生近緣種的遺傳滲入變異,增加了家養(yǎng)綿羊種群的遺傳多樣性,基因滲入為其地方綿羊的環(huán)境適應(yīng)提供了有益的遺傳變體異。并發(fā)現(xiàn)了與綿羊體型和體高、羊毛細(xì)度相關(guān)的基因位點(diǎn)。綿羊遷徙重建,發(fā)現(xiàn)了青銅時(shí)代早期和晚期橫跨歐亞草原和伊朗高原的兩次主要遷徙。這些遺傳變異資源對(duì)綿羊遺傳學(xué)家和育種者提供了非常寶貴的遺傳信息和工具。
北京百邁客生物科技有限公司高級(jí)產(chǎn)品經(jīng)理余瑩,通過(guò)系列高分文章案例向我們講述了基因組學(xué)研究目前的挑戰(zhàn)、機(jī)遇與未來(lái)展望。從基因組學(xué)研究的技術(shù)革新到大基因組、野生雜交材料與水生動(dòng)植物等復(fù)雜基因組序列物種問(wèn)題的解決,展現(xiàn)了三代測(cè)序尤其是HiFi測(cè)序在基因組學(xué)研究上的巨大優(yōu)勢(shì)。同時(shí)泛基因組、譜系基因組、物種變異研究給動(dòng)植物基因組學(xué)研究帶來(lái)了新的思路。未來(lái)更多0 Gap、雙單倍體基因組、性染色體組裝使得動(dòng)植物基因組得以完整解析,而完美基因組仍面臨巨大挑戰(zhàn),亟待等多技術(shù)的迭代與發(fā)展。
武漢大學(xué)趙華斌教授詳細(xì)講述了陸生脊椎動(dòng)物食性多樣性的分子進(jìn)化歷史,研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)鳥(niǎo)類和哺乳動(dòng)物的比較基因組學(xué)研究,解析了不同食性動(dòng)物的基因組中留下是相應(yīng)的遺傳印記,發(fā)現(xiàn)味覺(jué)受體基因、消化酶基因、代謝酶基因和免疫基因等在動(dòng)物食性分化中發(fā)揮重要的推動(dòng)作用。揭示鳥(niǎo)類和哺乳動(dòng)物食性多樣性的趨同和趨異演化模式,最終解析脊椎動(dòng)物食性適應(yīng)的遺傳機(jī)理,進(jìn)一步將通過(guò)表觀研究解析食性的遺傳調(diào)控與分析機(jī)理。
中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)曲魯江教授詳述了鴨的馴化歷史和表型機(jī)制,研究團(tuán)隊(duì)利用野生群體綠頭鴨和廣泛的家鴨遺傳資源,揭示了家鴨的馴化時(shí)間發(fā)生在距今 2200年前,發(fā)現(xiàn)與大腦、神經(jīng)發(fā)育以及脂質(zhì)代謝相關(guān)的基因在馴化過(guò)程中經(jīng)歷了高強(qiáng)度的選擇。并尋找到鴨白羽性狀的原因突變位點(diǎn)以及潛在的與肉質(zhì)、視覺(jué)、飛行等表型相關(guān)的候選基因、蛋肉鴨之間的差異基因,這些差異基因與免疫和繁殖性狀有緊密的關(guān)聯(lián)。根據(jù)表達(dá)數(shù)據(jù)識(shí)別的性別偏向表達(dá)基因在馴化過(guò)程中具有獨(dú)特的進(jìn)化特性,可能對(duì)應(yīng)著馴化過(guò)程中性選擇和遺傳約束的動(dòng)態(tài)變化。
華南師范大學(xué)李勝教授風(fēng)趣的為我們介紹了德國(guó)小蠊性激素調(diào)控相關(guān)研究。研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)轉(zhuǎn)錄組及相關(guān)驗(yàn)證實(shí)驗(yàn),在觸角中找尋到雄蟲(chóng)中表達(dá)量高于雌蟲(chóng)基因的CYP4PC1基因,該基因可能是控制信息素合成的關(guān)鍵基因。通過(guò)基因敲除的方式進(jìn)一步從表型中驗(yàn)證了CYP4PC1在信息素的產(chǎn)生和求偶的過(guò)程中具有重要的作用。后續(xù)研究表明,性別分化基因控制性二型CYP4PC1表達(dá)與調(diào)控,性別分化和激素信號(hào)協(xié)同調(diào)控CYP4PC1性吸引力,并使得小蠊成熟時(shí)只有一種性別具有性吸引力。最后李教授表明,通過(guò)性別分化和激素信號(hào)協(xié)同調(diào)控性吸引力可能在昆蟲(chóng)和哺乳動(dòng)物中普遍存在。
在濃厚的學(xué)術(shù)氛圍下,第八屆百邁客全國(guó)功能基因組學(xué)高峰論壇-動(dòng)物分會(huì)場(chǎng)落下了帷幕!峰會(huì)中圍繞動(dòng)物起源、進(jìn)化及遺傳多樣性、動(dòng)物育種及重要功能性狀遺傳機(jī)制解析等主題,分享了各位專家學(xué)者最研究進(jìn)展及經(jīng)驗(yàn)成果。相信每一位參會(huì)人員都受益匪淺,也祝愿每一位研究學(xué)者都能喜報(bào)頻頻!2022年,期待“第九屆全國(guó)功能基因組學(xué)高峰論壇”的再次到來(lái)!
我們——明年見(jiàn)!