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 分類: 時空組學(xué)
原文:空間分辨率下的C4+CAM整合光合代謝途徑
英文題目:Spatial resolution of an integrated C4+CAM photosynthetic metabolism
發(fā)表日期:2021.11.25
發(fā)表單位:耶魯大學(xué)
研究方向:馬齒莧葉片,植物光合作用

研究背景

文中以馬齒莧葉片為研究對象,在空間層面整合了光合作用中C4及CAM(Crassulacean acid metabolism,景天酸代謝)兩種不同代謝途徑的細(xì)胞定位。對于大部分植物,其光合代謝往往只涉及到上述一種途徑。馬齒莧是一種特殊的C4草本植物,在干旱脅迫下,亦可進(jìn)行CAM。

對馬齒莧葉片在水分充足和干旱條件下的葉肉和束鞘細(xì)胞群體進(jìn)行了兩種不同的空間基因表達(dá)分析,此外,測試了在多種情況下,C4和CAM在葉肉和束鞘細(xì)胞間整合的最有效生化模型,作為一個新的理論闡釋馬齒莧植物光合代謝機(jī)制。

研究方法

實(shí)驗(yàn)材料:馬齒莧葉片,水分充足葉片vs 干旱誘導(dǎo)葉片,3個不同區(qū)域,

實(shí)驗(yàn)方法:空間轉(zhuǎn)錄組(10x visium) ,單細(xì)胞測序(LCM-seq)

馬齒莧葉片干旱誘導(dǎo)CAM和激光捕獲顯微解剖

研究結(jié)論

1. 研究人員通過激光顯微技術(shù)對不同環(huán)境(水分充足及干旱環(huán)境,白天及夜間)葉片進(jìn)行切割區(qū)分,獲得葉肉,葉鞘及水分貯藏細(xì)胞,進(jìn)行傳統(tǒng)的轉(zhuǎn)錄組分析,并結(jié)合空間轉(zhuǎn)錄組測序及葉片的組織區(qū)分,分析了C4及CAM相關(guān)的差異表達(dá)基因,并建立了流量平衡模型,預(yù)測了干旱條件下c4 +CAM系統(tǒng)的完整性。

2. 在馬齒莧中,C4和CAM途徑與合成PEP相關(guān)的基因均在葉片中富集,而卡爾文循環(huán)相關(guān)基因只富集在葉鞘細(xì)胞中,表明馬齒筧的CAM途徑,不僅存在晝夜分離,也存在著空間的分離。糖運(yùn)輸?shù)脑黾优cCAM誘導(dǎo)有關(guān),G3P起源于束鞘,但PEP再生的最后步驟主要發(fā)生在葉肉中。CAM和c4固碳發(fā)生在相同的細(xì)胞中,CAM產(chǎn)生的代謝產(chǎn)物可能直接融入到C4循環(huán)中。

3. 作者建立了雙細(xì)胞-雙(晝夜)階段的光合代謝模型。當(dāng)水分充足時,馬齒筧葉片中只能檢測到少量的CAM途徑。而處于干旱環(huán)境時,可以進(jìn)行C4+CAM代謝途徑,此時馬齒筧中的C4途徑亦可利用CAM途徑產(chǎn)生的蘋果酸,大幅提高光合作用的效率。這一發(fā)現(xiàn)對C4 +CAM光合作用的空間明確描述,為作物改良提供了新的藍(lán)圖。

 

馬齒莧干旱脅迫下不同空間區(qū)域基因表達(dá)特征

 

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