中文題目:SDG(開環(huán)異落葉松脂素)的次生代謝物途徑觸發(fā)活性氧清除系統(tǒng)來響應(yīng)棉花 Ca 2+脅迫
英文題目:Secondary metabolite pathway of SDG(secoisolariciresinol) was observed to trigger ROS scavenging system in response to Ca stress in cotton.
背景與內(nèi)容
鈣是植物生長發(fā)育所必需的營養(yǎng)素,它不僅在植物細(xì)胞膜和細(xì)胞壁中的結(jié)構(gòu)物質(zhì),而且作為第二信使介導(dǎo)細(xì)胞內(nèi)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)。雖然人們對Ca2+在緩解植物各種生物和非生物脅迫中的作用及其調(diào)控機制進行了深入的研究,但棉花適應(yīng)高Ca2+脅迫的分子機制仍不清楚。我國棉花種質(zhì)資源豐富,分布廣泛,但我國種植的主要棉花種質(zhì)均不耐鈣。因此,從耐鈣品種中挖掘相關(guān)的耐鈣基因,揭示耐鈣機制,對于培育高產(chǎn)耐鈣材料具有重要意義。
本研究對103份棉花材料在200mMCaCl2脅迫下萌發(fā),從103份棉花材料中篩選出一個極端抗Ca2+基因型(中9807,R)和一個Ca2+敏感基因型(CRI50,S)。然后將這兩份材料分別在0mMCaCl2和200mMCaCl2中發(fā)芽5天,然后取樣進行轉(zhuǎn)錄組測序。形態(tài)學(xué)和生理學(xué)分析表明,在R中特異表達(dá)的PLR2可能通過促進SDG的合成來增強棉花清除活性氧的能力。綜上所述,本研究提出了棉花應(yīng)對高鈣脅迫的適應(yīng)機制,有助于提高棉花的抗逆性。
實驗材料與方法
1、CaCl2濃度篩選
在103份棉花材料的子葉期用不同濃度的CaCl(20mM、100mM、200mM、300mM、400mM和500mM)處理耐鹽棉花材料zhong9807,以0mMCaCl2處理為對照。
2、棉花材料
在本研究中,四個棉花品種的103份棉花材料在萌發(fā)期間受到200mMCaCl2脅迫。根據(jù)發(fā)芽情況,分別選擇了1份耐CaCl2脅迫的棉花品種(zhong9807,R)和1份對CaCl2脅迫敏感的品種(CRI50,S)。
3、轉(zhuǎn)錄組測序
用0mMCaCl2和200mMCaCl2脅迫棉籽發(fā)芽。將種子置于25℃的人工培養(yǎng)箱中,黑暗培養(yǎng)5天,收集萌發(fā)期的全株樣品,每個樣品重復(fù)三次。所有單個樣品放于?80?,用于生理測量和轉(zhuǎn)錄組分析。轉(zhuǎn)錄組分組情況:高抗性棉花(zhong9807,R)對照組RCK與實驗組RCa;敏感棉花(CRI50,S)對照組SCK和實驗組SCa。
4、qRTPCR分析
從CaCl2脅迫處理后的zhong9807(R)和CRI50(S)轉(zhuǎn)錄組中,隨機選擇20個差異基因進行qRTPCR驗證,最后分析qRT-PCR與RNA-seq的相關(guān)性。

圖1CaCl2處理后的棉花表型圖
結(jié)果與討論
1、ABA信號與Ca2+信號聯(lián)合緩解棉花高Ca2+脅迫
植物在受到非生物脅迫時,其細(xì)胞中的ABA會顯著增加,細(xì)胞質(zhì)中的Ca2+也會顯著增加,最后表皮細(xì)胞氣孔關(guān)閉和核轉(zhuǎn)錄反應(yīng)伴隨信號傳遞發(fā)生。在本研究結(jié)果中,高Ca2+脅迫后,2個編碼鈣調(diào)磷酸酶B樣蛋白(CBL)的基因、8個編碼CBL相互作用蛋白激酶(CIPK)的基因和4個編碼鈣依賴性蛋白激酶(CDPK)的基因的表達(dá)水增加。CBL、CIPK和CDPK是ABA信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑的關(guān)鍵基因,可感知與ABA相關(guān)的Ca2+濃度增加。CDPKs或CBL/CIPKs結(jié)合復(fù)合物隨后特異性調(diào)節(jié)下游靶點,包括ABA反應(yīng)元件(ABRE)和ABRE結(jié)合因子(ABF)。在R和S上調(diào)的基因中,分別鑒定了10個和百邁客生物科技8個編碼ABA反應(yīng)元件結(jié)合因子的基因。大多數(shù)基因編碼相同的元件,如ABF2、ABI5、DPBF2,但R的ABF3和DPBF3基因比S的多。研究表明,ABF2和ABF3不僅由ABA誘導(dǎo),而且還由滲透脅迫(如高鹽濃度和脫水)誘導(dǎo)。同時,DPBF3可以與ADF5的啟動子結(jié)合,ADF5的轉(zhuǎn)錄被ABA反應(yīng)元件激活。因此,在高Ca2+脅迫下,R的萎蔫程度比S輕,部分原因可能是ABA信號控制表皮細(xì)胞的氣孔關(guān)閉,減少水分損失,使植物保持直立。
2、通道蛋白參與離子和水平衡調(diào)節(jié)
通道蛋白AQPs可以形成一個促進水運輸所需的水特異性通道,從而提高了植物在各種非生物脅迫下的適應(yīng)性。差異基因富集分析發(fā)現(xiàn),R組中18個上調(diào)的DGEs在通道活性途徑(GO:0015267)顯著富集,其中16個基因編碼水通道蛋白(AQP),在S組中,13個上調(diào)的DGEs在通道活性途徑(GO:0015267)顯著富集,12個基因編碼AQP?;谇捌谘芯?,作者假設(shè)PIP2–2緩解了Ca2+脅迫,可能是因為細(xì)胞表皮上的水通道可以吸收細(xì)胞間隙的水分,這有利于維持棉花的原始含水量。如果細(xì)胞內(nèi)的水也可以通過PIP2–2從細(xì)胞內(nèi)輸送到細(xì)胞外,這可能是棉花R中Ca2+脅迫耐受的主要原因。在高Ca2+脅迫下,當(dāng)細(xì)胞質(zhì)Ca2+濃度增加時,PIP2–8將鈉或鉀運輸出細(xì)胞,并有助于維持細(xì)胞內(nèi)Ca2+平衡。因此,本研究推測PIP2–8和PIP2–2對植物耐高Ca2+脅迫的作用相同,它們都可以通過緩解滲透脅迫來提高棉花對高Ca2+脅迫的耐受性。同時,作者還發(fā)現(xiàn),高Ca2+脅迫后,R和S的shaker型K通道基因(SKOR)的表達(dá)水平上調(diào),但該基因在S中的表達(dá)高于在R中的表達(dá),推測SKOR編碼的鉀通道可能不是緩解R中高Ca2+脅迫的關(guān)鍵途徑。
3、高Ca2+脅迫下的Ca2+信號主要由CML蛋白介導(dǎo)
在非生物脅迫下,不同的Ca2+調(diào)節(jié)蛋白會對不同的脅迫作出反應(yīng)。在本研究中,高Ca2+脅迫下,Ca2+信號主要由CMLs、CBLs和CPKsCa2+感受器介導(dǎo)。此外,在R組上調(diào)的基因中,編碼這三種類型的基因分別為9、2和4個,其中編碼CML的基因數(shù)量最多。編碼CML的9個基因編碼不同類型的CML,其中CML10、CML21和CML22為R特異性表達(dá),CML8和CML41為S特異性表達(dá)。然而,在轉(zhuǎn)錄組R和S中的DEGs中沒有CaM相關(guān)基因。因此,我們推測CML是應(yīng)對高Ca2+應(yīng)激的主要Ca2+感受器。結(jié)果表明,在高Ca2+脅迫下,R可以通過提高CML的活性來清除植物體內(nèi)產(chǎn)生的ROS,從而提高棉花對高Ca2+脅迫的耐受性。
4、SDG的合成增強了棉花清除活性氧的功能
高Ca2+處理后,R組中存在一個特殊的KEGG途徑,即生物合成各種次級代謝產(chǎn)物-第2部分(KEGG:ko00998),它可以合成SDG,而SDG是植物中具有抗氧化活性的次生代謝產(chǎn)物,其在植物中的抗性機制尚不清楚。之前研究表明PLR1參與SDG的合成,且其啟動子與ABA轉(zhuǎn)錄激活調(diào)節(jié)有關(guān)。因此,ABA可以通過PLR1的轉(zhuǎn)錄調(diào)控促進SDG的合成和積累。在高Ca2+脅迫后,PLR2(GH\UA08G1771)在R中特異性表達(dá),在S中未檢測到PLR2表達(dá)的變化,這表明只有PLR2對R中的高Ca2+脅迫有反應(yīng)。因此,推測PLR2可能合成具有類似PLR1抗氧化特性的SDG。綜上所述,PLR2可以調(diào)節(jié)ABA信號轉(zhuǎn)導(dǎo)細(xì)胞功能相關(guān)的下游基因,共同提高高Ca2+脅迫下棉花清除活性氧的能力,從而增強棉花對高Ca2+脅迫的抗性。
5、高抗性棉花R緩解高Ca2+脅迫的分子機制
當(dāng)Ca2+從細(xì)胞外或液泡涌入細(xì)胞質(zhì)時,細(xì)胞質(zhì)中的Ca2+濃度會增加,Ca2+會與一些Ca2+受體蛋白CaM和CML結(jié)合,形成Ca2+/CaM(CML)結(jié)合蛋白。激活的Ca2+信號導(dǎo)致一些下游轉(zhuǎn)錄因子的表達(dá)增加,如WRKY和bZIP,通過調(diào)節(jié)細(xì)胞內(nèi)外水和離子的平衡,細(xì)胞在傳遞Ca2+信號后可以迅速恢復(fù)到低濃度Ca2+環(huán)境的狀態(tài)。同時,一些激素也受Ca2+信號的調(diào)節(jié),如ABA和SA,可以緩解棉花中的Ca2+瞬變。當(dāng)植物暴露于高濃度的Ca2+時,它們再也不能抵抗單獨由通道蛋白引起的大量Ca2+造成的損害。R將通過ROS清除機制與通道蛋白形成復(fù)雜的調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò),共同緩解高Ca2+應(yīng)激。滲透受體感應(yīng)到Ca2+的增加,然后調(diào)節(jié)ABA的合成,激活A(yù)BA信號通路。首先,增加的ABA與PYL蛋白結(jié)合并與PP2C相互作用,通過SnRK促進一些下游因子的磷酸化,并啟動ABA信號反應(yīng)。此時,編碼PLR2的轉(zhuǎn)錄因子ABRE和MYB被激活。然后,通過促進松脂醇合成落葉松烯醇,落葉松烯醇合成SDG,從而提高活性氧的清除能力,從而增強棉花抵御高Ca2+脅迫的能力(圖4)。

圖2:A-D:RvsS的DEGs在生物過程、細(xì)胞成分和分子功能中的GO富集圖;E-H:R與S的DEGsKEGG富集點圖(注:A:RCKvsRCa;B:RCavsSCa;C:SCKvsSCa;D:RCKvsRCavsSCKvsSCa中R特異性表達(dá)的DEGs;E:RCKvsRCa;F:RCavsSCa;G:SCKvsSCa;H:R-RCKvsRCavsSCKvsSCa中特異表達(dá)的DEG。)

圖3:高Ca2+脅迫下DEGs共表達(dá)熱圖

圖4高抗性棉花R對正常/異常濃度Ca2+脅迫的反應(yīng)(備注:CaM:鈣調(diào)蛋白;CML:鈣調(diào)素樣蛋白;CDPK:鈣依賴性蛋白激酶;ABRE:ABA反應(yīng)元件;MYBWRKYbHLH:轉(zhuǎn)錄因子;ABA:脫落酸;SA:水楊酸;SKOR:K通道;PIP:質(zhì)膜內(nèi)蛋白;TIP:液泡膜固有蛋白;PLR2:松脂醇-落葉松醇還原酶2編碼基因)
結(jié)論
本文主要探討不同棉花材料在高鈣脅迫下的不同耐性機制?;谵D(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和以往對非生物脅迫下各種機制的研究,推測棉花在高Ca2+脅迫下仍然通過Ca2+信號通路傳遞和激活各種信號。在高Ca2+脅迫后,與通道活性和抗氧化活性相關(guān)的基因可能占據(jù)相對較大的比例。通道蛋白通過平衡細(xì)胞內(nèi)外的水和陰離子來緩解高鈣脅迫下的滲透脅迫。同時,在Ca2+和ABA的相互作用下,棉花還通過促進SDG的生成來減輕氧化應(yīng)激,從而減少ROS在棉花中的積累。棉花耐高濃度Ca2+的分子機制將有助于促進高Ca2+地區(qū)植物的生長發(fā)育,為西部喀斯特地貌區(qū)植被恢復(fù)和荒漠化防治提供重要幫助。