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 分類: 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序

受不同物種影響。

LD是不同基因座上等位基因非隨機(jī)組合。但LD隨世代的增加、重組次數(shù)的增加而不斷下降。所以,那些繁殖力強(qiáng)、時(shí)代間隔短的物種(例如,昆蟲),其LD衰減的速度是非常快的;同一物種,不同群體類型,由于其遺傳背景不同,LD衰減速度也存在很大的差異。馴化群體,群體遺傳多樣性下降,位點(diǎn)間的相關(guān)性(連鎖程度)加強(qiáng)。所以,馴化程度越高,選擇強(qiáng)度越大的群體,LD衰減速越慢。同樣,自然選擇、遺傳漂變導(dǎo)致的群體遺傳多樣性下降,也會(huì)減慢LD衰減的速度;染色體在不同位置的LD衰減距離是不同的。通常著絲粒區(qū)更難重組,所以LD衰減更慢,而基因組上那些受選擇的區(qū)域相比普通的區(qū)域,LD衰減速度也是更慢的,因此分析結(jié)果提供了各個(gè)染色體獨(dú)立的LD分析結(jié)果。

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