亞細(xì)胞級別分辨率的細(xì)胞分割算法

期刊： Nature Methods

IF：48

時間：2023年7月

全文：http://cysolarrack.com/wp-content/uploads/2023/08/unnamed-file-4.pdf

作者開發(fā)了命名為亞細(xì)胞空轉(zhuǎn)細(xì)胞分割技術(shù)的算法：SCS。該算法相比其他分割算法更為準(zhǔn)確地識別每個細(xì)胞的位置，并能標(biāo)注其細(xì)胞類型。還能進一步提供有關(guān)細(xì)胞內(nèi)RNA分子的亞細(xì)胞定位的信息。從而使研究人員能夠深入探究細(xì)胞在組織內(nèi)的活動。

單細(xì)胞技術(shù)解析靈長類脊髓損傷修復(fù)機制

期刊：Nature Communication

IF：16.6

時間：2023年8月

全文：http://cysolarrack.com/wp-content/uploads/2023/08/unnamed-file-5.pdf

作者通過對構(gòu)建的胸段全橫斷脊髓損傷恒河猴模型進行了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序，深入解析了完全性脊髓損傷近端和遠(yuǎn)端不同區(qū)域的細(xì)胞動態(tài)變化。并進一步研究了膠原材料支架移植對完全性脊髓損傷不同區(qū)域的治療效應(yīng)和機制。

同時檢測轉(zhuǎn)錄水平與Hi-C的單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)

期刊：Nature Structural & Molecular Biology

IF：16.8

時間：2023年8月

全文：http://cysolarrack.com/wp-content/uploads/2023/08/hicmrna.pdf

作者建立了能實現(xiàn)了在單個細(xì)胞中同時檢測染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)（Hi-C）和轉(zhuǎn)錄表達(dá)的單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)方法——scCARE-seq。并利用小鼠胚胎干細(xì)胞中驗證了該方法的效果。結(jié)果表明，此方法優(yōu)化了單細(xì)胞Hi-C聚類結(jié)果，矯正了細(xì)胞周期的干擾，進一步促進Hi-C與轉(zhuǎn)錄之間動態(tài)調(diào)控關(guān)系的研究。